酵母蛋白胨的優勢：
動植物源蛋白胨是市場中主要的蛋白胨，對于比較粗放的發酵，該類產品具有一定的優勢。
但隨著酵母要求逐漸精細化、標準化后，這類蛋白胨的弊端逐漸暴露出來。
動植物生長的環境及一些外在因素，可能造成動植物生長狀態的波動，進而造成其體內蛋白含量波動，并且蛋白的儲存、提取和加工體系基本是開放的，可能會造成原料品質的變化（如變色、腐敗等）和營養成分的差異，最終導致蛋白胨產品質量的不穩定，以此為原料，勢必會影響發酵生產的穩定性；動物源蛋白凍可能存在致病性和風俗禁忌問題，植物性的蛋白胨主要存在過敏性和轉基因爭議問題。

蛋白胨的用途：
蛋白胨可以作為微生物培養基的主要原料，在抗生素、醫藥工業、發酵工業、生化制品及微生物學科研等領域中的用量均很大，可以用來治療消化道疾病；不同的生物體需要特定的氨基酸和多肽，因此存在各種蛋白胨。